Ok il transfer rate è basso. Però ci sarebbe da controllare gli IOPS per scupolo.
Anche se cmq credo che il problema non sia qua (vedi mia risp dopo) puoi dirmi il modello del controller? un lspci -v dovrebbe essere sufficiente.
Beh allora il collo di bottiglia è al 99% qua.
Sarebbe da vedere lo script cosa esegue.
Hai già provato a lanciare un analyze (
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/analyze-table.html ) in modo da verificare che non ci sia qualche indice rovinato?
Non sono granchè esperto in ambito mysql ma in Oracle una volta ho avuto problemi a causa di indici rovinati e reindicizzare la tabella mi ha risolto il problema (andava addiriturra in timeout tutta la query).
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